Для решения Вашего вопроса предлагаем скачать программу для разрезания аудиофайлов по трекам и использованием .cue-файлов Medieval CUE Splitter. Программа абсолютно бесплатна (спасибо разработчикам). Скачать ее можно с официального сайта. Для этого перейдите по этой ссылке. На рисунке 1 представлена страница загрузки программы Medieval CUE Splitter на момент написания этой статьи.
Кликните по ссылке "Download" (обозначена стрелкой 
), загрузится файл "cuesplitter_setup.exe".
Установка программы:
Запустите установочный файл программы, откроется окно установки (Рис. 2).
Нажмите кнопку "Next ". Откроется окно выбора каталога установки (Рис. 3).
Здесь можно изменить каталог, в который программа будет установлена. Для этого нажмите кнопку "Browse" и выберите нужную директорию. После этого нажмите кнопку "Next ". Откроется окно, сообщающее о готовности к началу установки (Рис. 4).
Для начала установки программы нажмите кнопку "Install". Начнется установка программы (Рис. 5).
После завершения установки, нажмите кнопку "Finish".
Работа с программой:
Запустите CUE Splitter, откроется окно (Рис. 7).
В верхнем меню программы выберите "Файл" - "Открыть CUE..." (Рис. 8).
В открывшемся окне выберите нужный файл .cue, который находится в той же директории, что и большой файл FLAC. После открытия файла окно примет следующий вид (Рис. 9).
Нажмите на кнопку "Разрезать", помеченную стрелкой . Откроется окно выбора каталога для готовых файлов. После выбора нужной директории, начнется работа программы (Рис.10).
Во время работы можно остановить разрезание файла. В этом случае созданные файлы останутся и их придется удалить вручную. После завершения работы программа выдаст соответствующее сообщение (Рис. 11).
Все готово! Готовые файлы лежат в указанном Вами каталоге.